Teismas pranešė, kad bauda V.Pakalkai skirta už tai, kad jis 2010 metais, laikinai eidamas NŽT direktoriaus pareigas, įstaigos vardu pateikė teismui tvirtinti taikos sutartį su bendrove „Alvilė“, kuriai įsiteisėjus valstybei būtų reikėję bendrovei sumokėti apie 2,3 mln. eurų tariamos žalos atlyginimo.
Įsikišus NŽT Teisės departamentui, taikos sutartis buvo atšaukta ir žalos valstybei išvengta. Vėlesniu teismo sprendimu minėtai bendrovei iš valstybės priteista apie 290 tūkst. eurų žalos atlyginimo.
„Alvilė“ 2008 metais pradėjo bylą prieš valstybę, reikalaudama atlyginti žalą, padarytą nutraukus valstybinės žemės nuomos sutartį. Didžiąją reikalavimų dalį sudarė reikalavimas atlyginti negautas pajamas. 2010 metų gruodį pasitarime, kuriame dalyvavo NŽT teisės departamento ir Teisingumo ministerijos atstovai, apsvarstytas „Alvilės“ pasiūlymas sudaryti taikos sutartį, pagal kurią valstybė įsipareigotų atlyginti bendrovei apie 2,9 mln. eurų žalą.
Pasitarime nuspręsta sprendimą dėl „Alvilės“ pasiūlytos taikos sutarties atidėti iki 2011 metų sausio mėnesio, nes kilo abejonių dėl įmonės pateikto reikalavimo atlyginti nepaprastai dideles negautas pajamas ir šių negautų pajamų paskaičiavimo metodikos teisingumo.
Žinodamas tokią NŽT ir Teisingumo ministerijos poziciją, taip pat žinodamas, kad tarnybą byloje įgaliotas atstovauti NŽT Teisės departamentas, V.Pakalka be šio departamento žinios ir sutikimo pasinaudojo tuo, kad nuo 2010 gruodžio 27 iki 30 dienos laikinai ėjo atostogaujančio NŽT direktoriaus Vito Lopinio pareigas.
V.Pakalka vienasmeniškai NŽT vardu pasirašė ir pateikė teismui tvirtinti taikos sutartį su „Alvile“, pagal kurią valstybei būtų tekusi prievolė atlyginti apie 2,3 mln. eurų žalą. 2011 metų sausį taikos sutartis atšaukta grįžusio iš atostogų NŽT direktoriaus V.Lopinio ir NŽT teisės departamento pastangomis.