Tačiau aštuoniasdešimtmetis popiežius pasmerkė žmonių klonavimą kaip moraliai nepriimtiną.

Popiežius kalbėjo prieš 5000 transplantacijos specialistų tarptautinį suvažiavimą, o tai rodo koks šis dalykas jam yra svarbus.

Jonas Paulius II ragino remti organų transplantaciją ir donorystę tarptautiniame transplantacijos specialistų kongrese, sakydamas: ”Reikia žmonių, ypač jaunų žmonių, širdyse išugdyti nuoširdų ir gilų broliškos meilės supratimą; meilės, kuri gali pasireikšti ir sprendimu padovanoti savo organą.”

Popiežius pasmerkė prekybą donorų organais, pareikalavo, kad donorystė būtų galima tik su abiejų šalių sutikimu (donoro ir recipiento) ir teigė, kad donoro organas gali būti persodintas tik po pilno šio smegenų funkcijų nutrūkimo.

Klonavimas akivaizdžiai kertasi su bažnyčios žiūrių, kad tik seksas yra vienintelis priimtinas būdas susituokusiai porai pradėti naują gyvybę.