Šv.Mišių metu tikintieji prisimins popiežiaus susitikimą su kunigais, klierikais, vienuoliais ir vienuolėmis. Rugsėjo 5 dieną Vilniaus Šventosios Dvasios bažnyčioje bus laikomos šv.Mišios lenkų kalba. Jų metu bus pašventinta popiežiaus apsilankymą įamžinanti atminimo lenta. Po mišių susirinkusieji prisimins popiežiaus susitikimą su Lietuvos lenkų bendruomene.
Vilniaus Šv.Juozapo kunigų seminarijoje vyks minėjimas, kurio metu Lietuvos akademinė visuomenė prisimins Šventojo tėvo susitikimą su mokslo, kultūros bei visuomenės atstovais. Taip pat bus paminėtos popiežiaus paraginimu atkurtos Šv.Juozapo kunigų seminarijos dešimtmetis.
Rugsėjo 6-ąją Vilniaus Šv.Teresės bažnyčioje, Kauno Arkikatedroje, Vilniaus Aušros Vartų koplyčioje bus laikomos šv.Mišios, po jų bus meldžiamasi rožinio malda. Šią maldą tiesiogiai transliuos Lietuvos nacionalinis radijas. Rugsėjo 12-ąją nuo Kryžių kalno prasidės piligrimų eitynės į Šiluvą. Iki Šiluvos maldininkai keliaus dvi dienas ir į pagrindinį popiežiaus apsilankymo Lietuvoje dešimtmečio minėjimą Šiluvoje atvyks rugsėjo 14 dieną.
Rugsėjo 14-ąją - paskutinę Šiluvos atlaidų dieną - Šiluvos Švč.Mergelės Marijos Gimimo bazilikoje įvyks pagrindinis popiežiaus Jono Pauliaus apsilankymo Lietuvoje dešimtmečio minėjimas. Šv.Mišias laikys Lietuvos vyskupai, jas tiesiogiai transliuos Lietuvos televizija.