Сейчас в природе зубры водятся в Кедайняйской, Паневежской и Радвилишкской мэриях. Популяцию искусственно расселили на территории, где ведется активная сельскохозяйственная деятельность. В таком регионе зубры зависимы от сельскохозяйственной деятельности, кроме того, наносят значительный ущерб фермерам, поедая и вытаптывая растения на полях.
В 1969-1972 гг. 10 зубров привезли в Пашиляйский зубровник из России. Первых появившихся на свет в зубровнике зубров выпустили на волю в 1973 году. В 2012 г. на воле жили 82 зубра, а в 2016 г. – 182.
Еще одна проблема - литовская популяция зубров, обитающая на воле, не может соединиться с другими популяциями. Поэтому велика вероятность инцеста. Проведенные в 2015 г. исследования показали, что генетическое разнообразие литовских зубров бедное.
Наилучший способ решения проблемы – переселение зубров в регион, находящийся ближе к популяциям зубров других стран. Если бы хотя бы часть зубров жила в южной части страны, то появилась бы возможность их смешения с популяциями белорусских и польских зубров.
Адаптационный загон планируют оборудовать в Дзукийском национальном парке, в Дайнавской пуще. Рядом находится Стегайляйский природный комплекс, в котором смогут жить зубры после того, как их выпустят на волю. Общая площадь этого комплекса - 540 га, там преобладают плодородные и влажные почвы, что обуславливает разнообразие леса.
