Это уже шестой глава японского правительства за последние пять лет.
За 54-летнего чиновника отдали голоса 215 депутатов парламента.
Ближайший конкурент - министр экономики и промышленности Банри Каиэда – набрал 177 голосов.
На посту премьер-министра Нода заменит Наото Кана, в пятницу объявившего о своей отставке. Кана постоянно критиковали за действия правительства после мартовского землетрясения.
Ранее сообщалось, что на эту должность также претендовали бывший министр иностранных дел Сейдзи Маэхара, министр торговли Банри Каэда, министр сельского хозяйства Мичихико Кано и министр транспорта Сумио Мабучи.
По словам корреспондента Би-би-си в Токио Роланда Берка, новому премьер-министру придется взять на себя руководство ликвидацией последствий разрушительного землетрясения, сопровождавшегося цунами и аварией на АЭС "Фукусима-1".
Восстановительные работы оцениваются как самые масштабные в Японии после Второй мировой войны.
Нода также должен будет разрешить продолжающийся кризис вокруг АЭС в Фукусиме, где все еще продолжается утечка радиации.
Новому лидер Японии также придется как-то убедить международные финансовые рынки, что его правительство сможет справиться с крупнейшим в западном мире объемом государственного долга, несмотря на разногласия в парламенте.
