Per savo karjerą vartininkas atstovavo Tauragės „Tauro“ ir Vilniaus „Žalgirio“ ekipoms. Pastarosios sudėtyje A lygoje šį sezoną E. Šetkus sužaidė šešiolika susitikimų.
„Žalgirio“ ekipoje liko antrasis klubo vartininkas Pavelas Leusas, o ekipą netrukus papildys Vilniaus „Vėtros“ vartininkas Mantas Galdikas.