Истцы утверждают, что российские власти выдвинули против компании необоснованные налоговые претензии, чтобы обанкротить ее и продать конкурентам, находящимся под госконтролем. Сумма претензий была рассчитана так: к компании были применены завышенные налоговые требования, в результате чего ЮКОС переплатил 33 млрд долларов, ее активы были проданы по заниженной цене, а акционеры хотели бы получить упущенную выгоду, напоминает представитель истцов Клэр Дэвидсон. Сумму определил независимый оценщик, которого одобрил суд, подчеркивает она.
Таким образом, ЮКОС как юридическое лицо просит признать российские власти виновными в нарушении сразу нескольких статей Европейской конвенции о защите прав человека и основных свобод. Это, в частности, право на справедливое разбирательство беспристрастным и независимым судом в разумный срок (ст. 6) - из-за допущенных нарушений при разбирательстве дел о неуплате налогов в 2000 году, отмечает "Время новостей".
Кроме того, в отношении незаконных налоговых претензий в 2000-2003 годах и продаже "Юганскнефтегаза" это право юридического лица беспрепятственно пользоваться своей собственностью; право на эффективные средства правовой защиты перед государственными органами; запрет на дискриминацию при использовании прав и свобод; запрет на применение допустимых ограничений прав и свобод для целей иных, чем те, для которых они были предусмотрены. Также ЮКОС требует признать нарушенной ст. 7 конвенции (нет наказания без закона), так как считает, что разбирательство по неуплате налогов в 2000-2003 годах не имело законных оснований и привело к необоснованному уголовному преследования и к двойному наказанию.
Жалоба ЮКОСА была подана в ЕСПЧ 23 апреля 2004 года, 29 января 2009 года суд частично принял эту жалобу к рассмотрению.
Глава Yukos International (американской "дочки" компании), бывший финансовый директор ЮКОСа Брюс Мизамор ранее заявлял, что "это самый большой иск за всю 60-летнюю историю Европейского суда по правам человека, не имеющий прецедента". По его словам, иск, поданный бывшим менеджментом компании, защищает интересы 55 тысяч акционеров, пострадавших в результате банкротства российской нефтяной компании.