Dabartinio rektoriaus Benedikto Juodkos kadencija baigiasi spalio 11 dieną. Jis, be kita ko, yra Socialdemokratų partijos kandidatas į Seimą.
Šiuo metu be J.Banio yra dar trys VU prorektoriai: akademinių reikalų prorektorius Juozas Galginaitis, administracijos reikalų prorektorius Aleksas Pikturna bei tarptautinių reikalų prorektorius Rimantas Vaitkus.
Pastarasis taip pat kandidatuoja į Seimą socialdemokratų partijos sąraše.
Kaip anksčiau sakė VU tarybos pirmininkas Kazimieras Motieka, viešas konkursas nuolatinio VU rektoriaus pareigoms eiti bus skelbiamas po to, kai Seimas patvirtins naują šios aukštosios mokyklos Statutą ir bus išrinkta nauja VU taryba.
B.Juodka antrai penkerių metų kadencijai išrinktas 2007 metų rugsėjo 13 dieną.
Tuomet jį į pareigas rinko universiteto Senatas, sudarytas iš akademinės bendruomenės narių. Pagal 2009 metais priimtą ir po Konstitucinio Teismo (KT) išaiškinimo 2012 pavasarį pataisytą Mokslo ir studijų įstatymą, rektorių renka Taryba. Šiuo metu galiojantis Mokslo ir studijų įstatymas numato, kad ne visą tarybą sudaro akademinė bendruomenė - taryba sudaroma iš devynių arba 11 narių, iš kurių keturi arba penki nepriklauso mokyklos personalui ir studentams.
VU Statutą tvirtinti Seimui buvo pateikęs ir prieš KT išaiškinimą. VU norėjo, kad Statutas būtų patvirtintas įstatymu, o ne nutarimu, kaip numato Mokslo ir studijų įstatymas, bei siekė daugiau autonomijos, nei numatė tuomet galiojusi Mokslo ir studijų įstatymo redakcija.