aA
Sausio pradžioje buvo paskelbta pirmoji SARS-CoV-2 – viruso, sukeliančio COVID-19 ligą, – genomo seka, pavadinta „Wuhan-1“. 30 tūkst. raidžių seka pažymėjo pirmąją dieną ilgame procese skubant suprasti šio naujai atsiradusio koronaviruso genetiką.
Koronaviruso mutacijos veda įdomiais keliais: ką mums pavyko iki šiol sužinoti
© DELFI / Domantas Pipas

Dabar su „Wuhan-1“ sujungta dar 100 tūkst. koronaviruso genomų, nustatytų iš COVID-19 pacientų kraujo mėginių daugiau nei šimte šalių. Ir genetikai iš viso pasaulio analizuoja šiuos duomenis, ieškodami atsakymų, skelbia sciencealert.com.

Iš kur atsirado SARS-CoV-2 virusas? Kada juo pradėjo užsikrėsti žmonės? Kaip virusas mutuoja, ir ar iš viso mutuoja? SARS-CoV-2 genomika, kaip ir pats virusas, sulaukia didžiulio dėmesio visame pasaulyje.

Išgirdus terminą „mutacija“, dažnai įsivaizduojami pavojingi nauji virusai su dar didesnėmis plitimo visoje planetoje galimybėmis. Ir nors mutacijos vyksta nuolat, ankstyvosios SARS-CoV-2 mutacijos įvyko dar pačioje pradžioje, kai virusas plito po pasaulį, ir buvo beveik nepastebimos. Mutacijos yra visiškai natūrali bet kurio organizmo, įskaitant ir virusus, dalis. Ir didžioji dalis tokių mutacijų neturi įtakos viruso gebėjimui platinti ar sukelti ligą.

Mutacija reiškia skirtumą. Vienos raidės pasikeitimą genome. Nuo tada, kai 2019 metų pabaigoje SARS-CoV-2 virusu užsikrėtė pirmasis žmogus, jo genome įvyko daugiau nei 13 tūkst. tokių pasikeitimų, kuriuos atskleidė iki šiol atlikta 100 tūkst. SARS-CoV-2 genomų sekoskaita.

Tačiau bet kurie du virusai, kuriais užsikrėtė bet kurie du pacientai pasaulyje, skiriasi vidutiniškai tik dešimčia raidžių. Tai yra mažytė dalis iš 30 tūkst. raidžių, esančių viruso genetiniame kode, o tai reiškia, kad visos SARS-CoV-2 variacijos, cirkuliuojančios pasaulyje, yra laikomos vienos genetinės linijos dalimi.

Lėtai mutuoja

Tam, kad virusas smarkiai genetiškai pasikeistų, reikia nemažai laiko. SARS-CoV-2 kaip virusas mutuoja gana lėtai: keli pokyčiai įvyksta kas mėnesį, o tai yra šešis kartus lėtesnė mutacija nei, pavyzdžiui, gripo virusų, per tą patį laikotarpį.

Visgi mutacijos yra pagrindinis principas, kurio pagrindu gali vykti natūrali atranka. Dažniausios mutacijos gali paversti virusą neveiksniu arba visai neturėti jokio poveikio. Tačiau taip pat egzistuoja galimybė, kad mutacijos paveiks tai, kaip perduodamas SARS-CoV-2 virusas.

Dėl to dedama vis daugiau pastangų nustatyti, kurios mutacijos iš iki šiol užfiksuotų SARS-CoV-2 genome Uhane gali smarkiai pakeisti viruso funkciją.

Viena liūdnai pagarsėjusi mutacija šiame kontekste yra amino rūgšties pasikeitimas SARS-CoV-2 viruso spyglio baltyme. Šis baltymas suteikia koronavirusams būdingą spygliuotą išvaizdą ir leidžia virusui prikibti prie ląstelių.

Nustatyta, kad vienos raidės pasikeitimas viruso genome – pavadintas D614G – gali padidinti viruso užkrečiamumą ląstelėse, užaugintose laboratorijoje, tačiau be jokio pamatuojamo poveikio ligos sunkumui.

Nors ši mutacija yra beveik sistemingai aptinkama kartu su trimis kitomis mutacijomis, šios keturios mutacijos yra randamos maždaug 80 proc. sekvenuoto SARS-CoV-2. Tai yra dažniausiai fiksuojamos viruso mutacijos.

Iššūkis D614G atveju, kaip ir su kitomis mutacijomis, yra išsiaiškinti, ar tokių mutacijų padaugėjo todėl, kad jų pasitaikydavo virusuose, atsakinguose už ankstyvus sėkmingus protrūkius, ar jie tikrai suteikia pranašumą savo nešėjams.

Nors vienos Jungtinės Karalystės duomenų basės pagrindu atlikta genominė analizė ir leidžia manyti, kad D614G vaidina nedidelį vaidmenį didindama viruso atmainų, kurios jį perduoda, spartesnį dauginimąsi, kitos analizės metu išmatuojamo poveikio viruso perdavimui nenustatyta.

Tiesiog keliauja kartu

D614G – ne vienintelė itin dažnai fiksuojama viruso mutacija. Taip pat SARS-CoV-2 viruso baltyminiame kiaute fiksuojamos dar trys dažnos mutacijos, kurios atrandamos trečdalyje virusų.

Vienas pokytis 57-oje Orf3a baltymo pozicijoje, o tai yra žinomas imunogeninis regionas, pasitaiko ketvirtadalyje virusų.

Kitos viruso spyglio baltymo mutacijos taip pat egzistuoja, o daugybę kitų, rodos, sukelia mūsų pačių imuninis atsakas. Be to, vis dar nesutariama, ar šie pokyčiai apskritai daro ženklų poveikį viruso virulentiškumui.

Dauguma mutacijų paprasčiausiai keliauja kartu su toliau sėkmingai plintančiu SARS-CoV-2 virusu.

www.DELFI.lt
Griežtai draudžiama DELFI paskelbtą informaciją panaudoti kitose interneto svetainėse, žiniasklaidos priemonėse ar kitur arba platinti mūsų medžiagą kuriuo nors pavidalu be sutikimo, o jei sutikimas gautas, būtina nurodyti DELFI kaip šaltinį.
|Populiariausi straipsniai ir video
Įvertink šį straipsnį
Norėdami tobulėti, suteikiame jums galimybę įvertinti skaitomą DELFI turinį.
(29 žmonės įvertino)
2.4483

6 pavojai, kuriuos jūsų kūnui kelia alkoholis: kenčia ne tik kepenys (38)

Visi žinome, kad piktnaudžiavimas alkoholiu labai kenkia sveikatai , tačiau ar žinote, kaip...

Kinijos erdvėlaivis „Chang‘e-5“ pakilo nuo Mėnulio paviršiaus ir grįžta į Žemę (7)

Kinijos erdvėlaivis „Chang‘e-5“ vėlų ketvirtadienį pakilo nuo Mėnulio paviršiaus ir jau...

Ir toliau skleidžia melą apie skiepus: klausia, kokia skiepų nauda, jei šie neveikia (47)

„Jei neskiepytas vaikas pražudo skiepytus vaikus, tai kokia prasmė skiepyti, jei galų gale gyvas...

Saulės sistema visiškai subyrės anksčiau nei galvojome: planetos „nuriedės“ per galaktiką (73)

Nors žemė po mūsų kojomis tvirta ir rami (dažniausiai), niekas šioje Visatoje netrunka amžinai.

Sugalvojo kaip įdarbinti tikruosius planetos plaučius: mažieji pagalbininkai gali virsti vandenilio gamyklomis

Ar žinojote, kad dumbliai pagamina didelę planetos deguonies dalį? Gerokai daugiau nei medžiai!...

Top naujienos

Profesorius Ambrozaitis siūlo pamiršti laikus, kai nedėvėjom kaukių: jų reikės kasmet (717)

Lietuva pagal sergamumą koronavirusu jau yra trečioje vietoje Europoje. Naujausi gruodžio 3...

Pigūs bilietai lietuvius vilioja spjauti į karantiną: lėktuvai pilni, o bilietai išperkami akimirksniu (159)

Be kelionių negalintys europiečiai masiškai bėga slėptis po Meksikos saule. Pilnuose lėktuvuose...

Savaitgalio prognozė: sugrįš rudeniški orai (6)

Šiandien, visą savaitgalį ir dar ateinančios savaitės pirmoje pusėje orų sąlygos mūsų...

Prasčiausius COVID-19 rodiklius fiksuojanti savivaldybė – apie kritinę situaciją: žmonės per daug atsipalaidavo (114)

14 dienų sergamumas 100 tūkst. gyventojų Kėdainių rajone – prasčiausias šalyje. Situacijai...

Vaizdo įraše – tikroji reakcija: ginkluotas Lukašenka juoką sukėlė net omonininkams (399)

Iniciatyva „By_Pol“, kuri vienija Baltarusijos jėgos žinybų darbuotojus, perėjusius į...

Kaunietį papiktino prie parduotuvių susidarančios eilės: prašo eiti apsipirkti tik turint konkretų sąrašą (85)

Ketvirtadienio vidurdienį keliose parduotuvėse ir paslaugų vietose apsilankiusiam kauniečiui teko...

Latvijoje vyriškių kompanija pavogė kalakutą, jį prigirdė degtine ir kartu išvažiavo į kurortą (64)

Imante miestelyje, Latvijoje, vyriškių kampanija iš vietos pramogų parko pavogė kalakutą, jį...

Proeuropietiškai Moldovos prezidentei – šalies parlamento akibrokštas (61)

Moldovos įstatymų leidėjai ketvirtadienį priėmė įstatymą, kuriuo apribojami prezidentūros...

COVID-19 pasiglemžė 37-erių Lietuvos stipruolio gyvybę (114)

Nuo koronaviruso infekcijos Kuršėnuose mirė sunkiaatletis, daugkartinis Lietuvos štangos...

6 pavojai, kuriuos jūsų kūnui kelia alkoholis: kenčia ne tik kepenys (38)

Visi žinome, kad piktnaudžiavimas alkoholiu labai kenkia sveikatai , tačiau ar žinote, kaip...

|Maža didelių žinių kaina