J. Mačys gimė 1938 m. balandžio 18 d. Marijampolės mieste. 1964 m. baigė Lietuvos žemės ūkio akademiją, agronomas ekonomistas, žemės ūkio mokslų kandidatas.
1958-1962 m. dirbo Marijampolės rajono "Dovinės" ir "Naujo gyvenimo" kolūkiuose vyriausiuoju agronomu; 1962-1964 m. - Šakių rajono žemės ūkio valdybos vyresniuoju agronomu, Trakų rajono Aukštadvario žemės ūkio technikume dėstytoju; 1964-1978 m. - Šakių rajono "Aušros" kolūkyje vyriausiuoju agronomu, Vilkaviškio rajono kolūkyje "Į komunizmą" pirmininko pavaduotoju gamybos reikalams; 1978-1990 m. - Vilkaviškio rajono Rumokų bandymų stotyje vyresniuoju moksliniu bendradarbiu.
1988-1990 m. - Vilkaviškio rajono žemdirbių sąjūdžio pirmininkas, Lietuvos Persitvarkymo Sąjūdžio Vilkaviškio rajono tarybos pirmininkas, Lietuvos žemdirbių sąjūdžio tarybos narys.
1990-1992 m. - Lietuvos Respublikos Aukščiausiosios Tarybos-Atkuriamojo Seimo deputatas. Dirbo Agrarinės komisijos pirmininko pavaduotoju.
1992-1995 m. dirbo Rumokų bandymų stotyje vyriausiuoju moksliniu bendradarbiu. 1995-1997 ir 1997-2000 m. - Vilkaviškio rajono savivaldybės meras. 1997-2000, 2000-2003, 2003-2006 m. - Vilkaviškio rajono savivaldybės tarybos narys.
Nuo 1990 m. - Lietuvių tautininkų sąjungos (LTS) narys, 2003 m. - LTS pirmininko pavaduotojas.
2000-2004 m. - Šiaulių banko atstovas Vilkaviškio rajone.
2006 metų pabaigoje pradėjo kaimo turizmo verslą Vilkaviškio rajone.
Yra paskelbęs mokslinių straipsnių žemės ūkio klausimais.
2000-aisiais buvo apdovanotas Lietuvos Nepriklausomybės medaliu.
