Nepaisant Seimo Tėvynės sąjungos - konservatorių frakcijos prieštaravimų bei nepalankių Seimo Teisės Departamento ir Aukščiausiojo Teismo išvadų, Seimo dauguma neišbraukė Prokuratūros įstatymo 11 straipsnio 4 dalį papildančios nuostatos, jog generalinis prokuroras gali būti keičiamas "pasikeitus generalinio prokuroro skyrimo tvarkai, kai įstatymas nustato kitus generalinį prokurorą skiriančius subjektus".
Be to, projekte numatyta, kad nuo Prokuratūros įstatymo pakeitimų įsigaliojimo datos nutrūksta Seimo paskirto generalinio prokuroro įgaliojimai ir jis laikinai eina generalinio prokuroro pareigas, kol bus paskirtas generalinis prokuroras.
Tokiu atveju dabartinis Generalinės prokuratūros vadovas Kazys Pėdnyčia atsistatydintų, nebaigęs savo 7-erių metų kadencijos. Jis buvo Seimo patvirtintas generaliniu prokuroru 1997 metais.