Pagal Vyriausybės įstatymą, sekretorius - aukščiausias karjeros valstybės tarnautojas ir pasikeitus ministrų kabinetui lieka savo poste.

Premjero R. Pakso nuomone, profesionalūs ir gerai atliekantys pareigas valstybės tarnautojai neturėtų būti keičiami keičiantis politikams, kaip ir numato Valstybės tarnybos įstatymas. Tokiu būdu užtikrinamas svarbių darbų tęstinumas ir valdymo institucijų stabilumas, pranešė Vyriausybės spaudos tarnyba.

38-rių metų A. Šemeta Vyriausybės sekretoriumi pradėjo dirbti konservatoriaus Andriaus Kubiliaus vadovaujamoje Vyriausybėje pernai gruodį, išlaikęs kvalifikacinį egzaminą šiam postui gauti.

Vyriausybės sekretorius yra vienas aukščiausių karjeros pareigūnų, koordinuojantis Vyriausybės ir ministerijų santykius.

Nuo 1997 vasario iki 1999 metų gegužės A. Šemeta dirbo finansų ministru konservatoriaus Gedimino Vagnoriaus kabinete.

A. Šemeta yra siejamas su G. Vagnoriaus reguliariai rengtomis "žiauriomis akcijomis" mokesčių administravimo srityje.