Finansinių nusikaltimų tyrimo tarnyba įpareigota rinkti, kaupti, analizuoti ir apibendrinti informaciją apie ES ir užsienio valstybių finansinės paramos lėšų neteisėtą gavimą ir panaudojimą.

Lietuva iš ES 2004-2006 metais gaus 2,679 mlrd. eurų (9,2 mlrd. litų) išmokų.

2002 metų Vyriausybės nutarimu Finansinių nusikaltimų tyrimo tarnyba taip pat yra paskirta institucija, atsakinga už bendradarbiavimą su Europos kovos su sukčiavimu tarnyba.

Finansinių nusikaltimų tyrimo tarnyba taip pat turės teikti raštišką informaciją apie valstybės turto privatizavime dalyvaujančių asmenų patikimumą.

Diskusijų apie investuotojų patikimumą kilo tada, kai buvo suabejota privatizuojamų alkoholio įmonių potencialių investuotojų kapitalo skaidrumu bei jų galimais ryšiais su nusikalstamomis struktūromis.